Más allá del trombón, también ha trabajado como compositor, arreglista y cantante, y finalmente como productor y director. Combinando elementos de jazz, rock y salsa, su obra incorpora los ritmos de la música tradicional de Cuba, Puerto Rico, Brasil y África.  

Colón colaboró con éxito con músicos y cantantes de salsa como Ismael Miranda, Celia Cruz, Soledad Bravo y el cantautor Rubén Blades. Un tema importante en la música de Colón -que se inspira en muchas culturas y varios estilos diferentes- es la exploración de las asociaciones contrapuestas que los puertorriqueños tienen con su hogar y con los Estados Unidos. Utiliza sus canciones para describir e investigar los problemas de vivir en Estados Unidos como puertorriqueño y también para insinuar las contribuciones culturales que los puertorriqueños tienen que ofrecer.  

En septiembre de 2004, Colón recibió el Grammy a la Trayectoria^® de la Academia Latina de Artes y Ciencias de la Grabación. A lo largo de su carrera, ha colaborado con notables músicos como la Fania All-Stars, Héctor Lavoe, Rubén Blades, David Byrne y Celia Cruz. Siembrasu disco con Rubén Blades, fue el más vendido en su género. Colón publicó su álbum El Malo Vol. II: Prisioneros del Mambo en 2008, con los singles "Amor de Internet" y "Corazón Partido".

En 2015, Billboard Magazine nombró a Willie Colón como uno de los 30 artistas latinos más influyentes de todos los tiempos. En 2016, comenzó su Gira 50 Aniversario, que se extendió hasta 2017 y presentó conciertos en Puerto Rico, Colombia, Nueva York, Los Ángeles, Miami, Tampa, México, París, Milán, Madrid, Barcelona, Melbourne y Sydney.

En 2017, Colón anunció su libro, Barrio de Guapos (La vida secreta de Willie Colón) y el lanzamiento de su sello discográfico Willie Colón Presents.

Colón ha sido presidente de la Asociación de Artes Hispánicas. También ha actuado en películas, incluyendo papeles en Vigilante (1983), El último combate (1983), y Podría pasarte a ti (1994). En 2006, fue interpretado por el actor John Ortiz frente a Héctor Lavoe, de Marc Anthony, en la película El Cantanteprotagonizada por Jennifer López. La película trata sobre la vida de Héctor Lavoe; cubre la carrera temprana del dúo como el mejor dúo de salsa desde los años 60 hasta mediados de los 70.

Colón ha sido un activista de los derechos civiles, comunitarios y políticos desde los 16 años. Ha sido miembro de la Comisión Latina sobre el SIDA y de la Fundación de Inmigrantes de las Naciones Unidas, presidente de la Coalición Arthur Schomburg para un Nueva York Mejor y miembro del Consejo de Administración del Instituto del Caucus Hispano del Congreso. En 1995, Colón se convirtió en la primera persona perteneciente a una minoría en formar parte de la junta nacional de la Sociedad Americana de Compositores, Autores y Editores (ASCAP) y actualmente es miembro de la Fundación ASCAP. 

En 1999, Colón formó parte de la Delegación del Jubileo 2000 en el Vaticano junto con Randolph Robinson, de Trans Africa, el economista de Harvard Jeffrey Sachs, Bono de U2 y Quincy Jones. En 2001, Willie Colón se presentó como candidato a Defensor del Pueblo de la ciudad de Nueva York, obteniendo unos respetables 101.393 votos, más que muchos otros candidatos de la ciudad. 

Además de ser profesor visitante y recibir títulos honoríficos de música y letras humanas en varias universidades, en 1991, Colón recibió la beca Chubb de la Universidad de Yale. Ha sido asesor representante del ex alcalde de Nueva York, Michael Bloomberg, y enlace con la Comisión de Entretenimiento de los Medios Latinos (de la que Robert De Niro y Jennifer López fueron los presidentes de las celebridades). La base de operaciones de Colón, ELMALO, está en New Rochelle, Nueva York. 

En 2010, Colón apareció en el National Mall para el Earth Day Climate Rally, junto con Sting, John Legend, The Roots, Jimmy Cliff, Passion Pit, Bob Weir, Joss Stone, Robert Randolph, Patrick Stump, Mavis Staples, Booker T, Honor Society y Tao Rodríguez-Seeger. 

En 2011, la Westchester Hispanic Law Enforcement Association reconoció a Colón por su activismo y apoyo social y comunitario. En 2014, Willie Colón se unió al Departamento del Sheriff del Condado de Westchester como ayudante del sheriff. Actualmente es teniente adjunto en el Departamento de Seguridad Pública del Condado de Westchester. 

Gestión y reservas: pietrocarlos@mac.com